定量PCR法进行文库定量
能够不受目的片段GC含量及长度的影响,进行正确的定量
Illumina公司二代测序用文库定量试剂盒
GenNext™ NGS Library Quantification Kit
Code No. | 包装 | 价格 | 保存温度 | 说明书 |
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NLQ-101 | 500次份 | RMB 5,450 | -20℃ | - |
NLQ-101S | 50次份 | RMB 1,100 | -20℃ | - |
【产品内容】
・KOD SYBR® qPCR Mix*
KOD SYBR® qPCR Mix
50x ROX reference dye
・Standard & Primer Set
Standard DNA 1~6**
5× Primer Mix
50× Dilution Buffer
*含有1个套装的KOD SYBR® qPCR Mix (Code: QKD-201)。
**含有20 pM, 2 pM, 0.2 pM, 0.02 pM, 0.002 pM, 0.0002 pM 浓度的Standard DNA 。
※20 μl 反应体系500次份。
【产品用途】
Illumina公司二代测序用文库定量
【产品说明】
GenNextTM NGS Library Quantification Kit是illumina® 二代测序用的文库定量试剂盒。文库定量的方法有分光光度检测法及荧光测定法,这些测定法中,因为测定的是全部的DNA,所以不能正确地测定对测序有效的加了P5、P7接头的DNA的浓度。GenNextTM NGS Library Quantification Kit中,设计了能与Illumina公司采用的P5、P7序列配对的引物,来进行qPCR法进行分析,只能准确地定量能够结合在Flow cell的文库。另外,因为使用了KOD SYBR® qPCR Mix,长链及GC丰富的目的片段,也可以稳定进行文库定量。
【产品特征】
低偏差的正确定量
使用了KOD SYBR® qPCR Mix,不易受文库GC含量及长度影响,无论何种文库都可以正确的定量。使用本试剂盒定量
得到的值,可以得到稳定的簇密度。
可以较广的范围内进行定量
备有从20pM至0.0002pM的6个浓度的Standard DNA,能够在较广的范围内正确地定量。
简便
本试剂盒含有文库定量必需的全部试剂(qPCR试剂、Primer Mix、Standard DNA及文库稀释用buffer),可以简单地进行文库定量。
【实验案例】
1.不同目的片段长度时PCR效率的比较
用各公司的文库定量试剂盒对附加有接头序列的150~800bp的模板DNA进行分析,比较了PCR效率。结果显示,其他公司的文库定量试剂盒随着目的片段长度的变长,可以看到PCR效率降低,本试剂盒没有因目的片段长度变化而出现PCR效率下降。
2.各种GC含量的目的片段的PCR效率比较
用各个公司的文库定量试剂盒对附加有接头序列的各种GC含量的模板DNA进行分析 ,比较PCR效率。结果显示:其他公司的文库定量试剂盒在定量GC含量高的目的片段时,如融解曲线分析图所示,不能确认目的片段的扩增,PCR效率也不能测定。另一方面,使用本试剂盒可特异地扩增全部的目的片段,而且各目的片段的PCR效率误差也最小。通常,含有CpG的启动子区域或嗜热菌等细菌中GC含量比较高。在对其进行文库定量时,使用不易受GC影响的本产品就可以正确地进行定量。
3.使用易于形成二级结构的短链目的片段进行探讨
将附加有接头序列的miRNA(human let-7a)序列(144bp)和Standard DNA为模板进行分析得到的扩增曲线进行比较。将miRNA目的片段稀释至20pM之后,按10倍的梯度进行稀释,与试剂盒中添加的Standard
DNA同时进行分析。结果显示,miRNA目的片段与Standard DNA的扩增曲线与各稀释水平基本一致,PCR效率分别是97.8%(miRNA)和97.1%(Standard DNA),也基本相等。通过本次探讨可以确认:像miRNA这样的易于
形成二级结构的短链目的片段,使用本试剂盒,也能够准确地进行定量。
【相关产品】
品名 | Code No. | 包装 | 价格 | 保存温度 | 说明书下载 |
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KOD SYBR® qPCR Mix | QKD-201 | 1.67ml× 3支 | RMB 2,450 | -20℃ |
购买人 | 会员级别 | 数量 | 属性 | 购买时间 |
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